Enquanto procurava no sótão de seu avô, Hikaru Shindou se depara com uma velha prancha. Ao tocá-lo, ele é saudado por uma voz misteriosa e logo em seguida cai inconsciente. Quando ele recupera os sentidos, ele descobre que a voz ainda está presente e pertence a Fujiwara no Sai, o espírito de um antigo especialista em go. Instrutor de go do imperador japonês na Era Heian, a paixão de Sai pelo jogo transcende o tempo e o espaço, permitindo-lhe continuar jogando seu amado jogo como uma entidade fantasmagórica. O objetivo final de Sai é dominar uma técnica de go divino que nenhum jogador conseguiu até agora, e ele busca conseguir isso jogando o jogo de tabuleiro através de Hikaru. Apesar de não ter interesse em jogos de tabuleiro, Hikaru relutantemente concorda em jogar, executando movimentos conforme as instruções de Sai. No entanto, quando ele encontra o jovem prodígio Akira Touya, uma paixão pelo jogo é lentamente acesa dentro dele. Inspirado por seu novo rival, a jornada de Hikaru no mundo do go está apenas começando.
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