A personagem principal é a Sasami, ela nasceu com poderes mágicos, porém a pedido de seu pai mantém em segredo de todos. Quando um novo ano escolar começa, Sasami com sua personalidade alegre e muito energética, se envolve com uma nova estudante introvertida e quieta chamada Misao numa tentativa de fazer amizade com ela. E as duas são surpreendidas pela nova enfermeira da escola, Washu, que as convida para fazerem parte de seu clube de culinária que na verdade era uma fachada para esconder o seu verdadeiro nome, o Clube das Garotas Mágicas! A partir daí a vida de Sasami e de suas novas amigas mudarão drasticamente com dia-a-dia bem agitado!
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