O sistema Mizuhanome é um desenvolvimento altamente avançado que permite às pessoas entrar em um dos lugares mais intrigantes da existência - a mente humana. Através do uso das chamadas partículas de cognição deixadas para trás na cena do crime pelo perpetrador, os detetives do esquadrão policial especializado Kura podem manifestar a mente inconsciente de um criminoso como um fluxo bizarro de pensamentos em um mundo virtual. Sua tarefa é explorar esse plano psicológico, denominado poço do id, para revelar a identidade do culpado. Nem qualquer pessoa pode entrar nos poços de identificação; o pré-requisito é que você mesmo deve ter matado alguém. É o caso do ex-detetive Akihito Narihisago, conhecido como Sakaido dentro dos poços de identidade. Antes um respeitado membro da polícia, a tragédia o atingiu e ele logo se viu do outro lado da lei. No entanto, Narihisago continua ajudando Kura no confinamento. Embora suas prodigiosas habilidades de detetive ainda sejam úteis para as investigações, Narihisago descobre que nem tudo é o que parece, já que por trás da série aparentemente autônoma de casos de assassinato se esconde uma verdade muito mais sinistra.